《生命科学》 2014, 26(3): 239-247

RNA中的假尿苷修饰：形成、功能及鉴定

李笑雨^1#，孙芳芳^2#，伊成器^1，3*

(1 北京大学生命科学学院，蛋白质与植物基因研究国家重点实验室，北京100871；2 清华大学生命科学学院，北京100084；3 北京大学合成与功能生物分子中心，北京大学-清华大学生命科学联合中心，北京100871)

摘　要：假尿苷修饰是目前已知丰度最高的RNA 修饰，广泛存在于多个物种的多类RNA 中。作为尿苷的5 位异构体，假尿苷在真核生物中的形成机制主要有两种：依赖于假尿苷合酶或是依赖于H/ACA 核糖核蛋白复合体。假尿苷修饰在多个生物学过程中发挥作用，同时不同位点的假尿苷修饰具有不同的功能。而人为地在mRNA 终止密码子中引入假尿苷修饰则可以使其具有编码能力，这改变了传统的中心法则。目前对于RNA 中假尿苷的研究主要是通过2D-TLC 及液质联用对其进行定量分析，使用CMCT 标记假尿苷及RNase H 和SCARLET 的方法对其进行定位。

Pseudouridines in RNA: formation， function and characterization

LI Xiao-Yu^1#， SUN Fang-Fang^2#， YI Cheng-Qi^1，3*

(1 State Key Laboratory of Protein and Plant Gene Research， School of Life Sciences， Peking University， Beijing 100871， China; 2 School of Life Sciences， Tsinghua University， Beijing 100084， China; 3 Peking-Tsinghua Joint Center for Life Science， Synthetic and Functional Biomolecules Center， Peking University， Beijing 100871， China)

Abstract: Pseudouridine is the most abundant RNA modification and it is widely spread in various RNAs of many organisms. As a rotation isomer of uridine， it is formed mainly through two mechanisms: stand-alone pseudouridine synthases and Box H/ACA Ribonucleoprotein. Pseudouridylation affects many cellular processes， with distinct functions at different sites in RNA. When incorporated into mRNA artifically， nonsense codons-containing pseudouridine can be converted into sense codons. To characterize pseudouridine in RNA， 2D-TLC and LC-MS have been used for quantification purposes， while CMCT-based labeling method， RNase H-based digestion method and most recently “SCARLET” method can all be applied for mapping the pseudouridine sites in RNA.